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以是尚未呈现正在模子中?表征

时间:2019-04-30来源:未知 作者:admin点击:
某些非致病性细菌菌株大肠杆菌K-12 MG1655正在试验室顶用于推敲微生物代谢体例生物学长短常名贵的。然而,正正在序列的大肠杆菌数目的增进显着使得K-12 MG1655仅组成大肠杆菌物种中基因组众样性的一小个别。 该团队操纵GEM检测分歧菌株正在约650种分歧养分处

  某些非致病性细菌菌株大肠杆菌K-12 MG1655正在试验室顶用于推敲微生物代谢体例生物学长短常名贵的。然而,正正在序列的大肠杆菌数目的增进显着使得K-12 MG1655仅组成大肠杆菌物种中基因组众样性的一小个别。

  该团队操纵GEM检测分歧菌株正在约650种分歧养分处境中滋长的才力。他们呈现菌株的滋长弧线与其致病性温和应界限处境的才力相对应。GEM还用于预测菌株是否可能合成某些对滋长至合要紧的维生素,并准许团队依照常睹的代谢才力确定大肠杆菌菌株之间的分歧。

  为了更好地了然大肠杆菌物种的代谢潜力,由圣地亚哥加利福尼亚大学的Jonathan Monk指示的一组推敲职员,囊括开罗大学的Ramy Aziz,构修了新陈代谢的基因组周围模子(GEMs),将代谢基因与代谢途径相立室,用于55个全体测序的大肠杆菌菌株。

  “咱们或许验证80%的筹划预测的实情令人震恐,由于他们晓畅这些预测是针对55个基因组筹划出来的,”阿齐兹说。“依旧有良众事情要做,由于高出三分之一的大肠杆菌基因产物的功用依旧未知,以是尚未呈现正在模子中。”

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